في صباح يوم الأحد الواقع فيه 7 ايار 2023، اندلع حريق في مكتب الكنيسة المجاور للكنيسة الإنجيلية الأرمنية في عنجر. مما تسبّب في أضرار مادية كبيرة، ولكن دون خسائر بشرية أو إصابات. تسبب الحريق، الذي بدأ في نظام التدفئة بالكنيسة، في إتلاف المعدات وسجلات الكنيسة، فضلاً عن التسبب في أضرار دخان في جميع أنحاء المبنى.
نُشارك صور لمبنى الكنيسة بعد الحريق، كما صورة للكنيسة قبل الحريق حين زارها وفد من رعاة السينودس الإنجيلي الوطني في سورية ولبنان في 21 أيلول 2022.
